1. Về mức đóng thuế môn bài. 
Theo quy định tại Thông tư số 33/VBHN-BTC ngày 14/7/2014 thì việc đóng thuế môn bài sẽ căn cứ trên số vốn đã đăng ký trong Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh hoặc Giấy phép đầu tư, theo đó:

BẬC THUẾ MÔN BÀI	VỐN ĐĂNG KÝ	MỨC THUẾ MÔN BÀI CẢ NĂM
- Bậc 1	Trên 10 tỷ	3.000.000
- Bậc 2	Từ 5 tỷ đến 10 tỷ	2.000.000
- Bậc 3	Từ 2 tỷ đến dưới 5 tỷ	1.500.000
- Bậc 4	Dưới 2 tỷ	1.000.000

2. Về việc chi nhánh có phải nộp thuế môn bài hay không?
Theo quy định tại Khoản 2 Phần II Thông tư số 33/VBHN-BTC thì "cơ sở kinh doanh đăng ký nộp thuế với cơ quan thuế cấp nào thì nộp thuế Môn bài tại cơ quan thuế cấp đó. Trường hợp cơ sở kinh doanh có nhiều cửa hàng, cửa hiệu trực thuộc nằm ở các điểm khác nhau trong cùng địa phương thì cơ sở kinh doanh nộp thuế Môn bài của bản thân cơ sở, đồng thời nộp thuế Môn bài cho các cửa hàng, cửa hiệu trực thuộc, đóng trên cùng địa phương. Các chi nhánh, cửa hàng, cửa hiệu đóng ở địa phương khác thì nộp thuế Môn bài tại cơ quan thuế nơi có chi nhánh, cửa hàng, cửa hiệu kinh doanh."

Các cơ sở kinh doanh nếu có các cửa hàng, quầy hàng, cửa hiệu, điểm kinh doanh dịch vụ... ở các địa điểm khác không cùng địa điểm của cơ sở thì mỗi cửa hàng, quầy hàng, cửa hiệu, điểm kinh doanh dịch vụ ... phải nộp thuế Môn bài theo mức 1.000.000 đồng một năm.